Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprvP70289 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprvP70289 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprvP70289 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprvP70289 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprvP70289 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprvP70289 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprvP70289 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms