Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfn1P62962 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfn1P62962 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfn1P62962 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfn1P62962 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfn1P62962 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pfn1P62962 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pfn1P62962 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pfn1P62962 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfn1P62962 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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