Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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