Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PlnP61014 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PlnP61014 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PlnP61014 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
PlnP61014 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
PlnP61014 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PlnP61014 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PlnP61014 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PlnP61014 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PlnP61014 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PlnP61014 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PlnP61014 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms