Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms