Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp5P56399 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms