Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pms2P54279 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms