Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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