Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hcls1P49710 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcls1P49710 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms