Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnni3P48787 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms