Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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