Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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