Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl28P41105 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms