Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VhlP40338 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VhlP40338 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VhlP40338 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VhlP40338 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VhlP40338 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VhlP40338 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VhlP40338 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VhlP40338 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VhlP40338 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VhlP40338 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms