Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd1P40201 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd1P40201 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms