Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms