Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprkP35822 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms