Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6dP35459 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms