Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn11P35235 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn11P35235 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms