Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnd1P30999 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms