Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BgnP28653 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BgnP28653 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
BgnP28653 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
BgnP28653 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BgnP28653 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BgnP28653 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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