Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfraP26618 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms