Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms