Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tln1P26039 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms