Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a1P24549 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms