Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZfaP23607 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZfaP23607 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms