Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms