Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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