Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrm1P12657 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms