Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cxcl2P10889 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms