Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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H2-Eb1P04230 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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