Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AurkcO88445 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms