Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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DffaO54786 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DffaO54786 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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DffaO54786 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DffaO54786 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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DffaO54786 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffaO54786 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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