Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clk2O35491 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms