Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms