Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f3O35261 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f3O35261 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f3O35261 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms