Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6871L7N248 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms