Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20918J3QN17 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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