Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3415J3QMS8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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