Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn34c3J3QJW5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn34c3J3QJW5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn34c3J3QJW5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn34c3J3QJW5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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