Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcf11G3X9Z4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms