Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna9G3X8Z7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna9G3X8Z7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms