Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms