Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms