Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LctF8VPT3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LctF8VPT3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms