Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H2-M1F7CXU4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H2-M1F7CXU4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H2-M1F7CXU4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H2-M1F7CXU4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H2-M1F7CXU4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H2-M1F7CXU4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H2-M1F7CXU4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H2-M1F7CXU4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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H2-M1F7CXU4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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