Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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