Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crocc2F6XLV1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms