Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8247F6VRJ8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8247F6VRJ8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms