Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm340F6RGI3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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